في إحدى زوايا مسجد الجامعة بالجانب الشمالي الشرقي تقع مكتبة المسجد، حيث تتمتع بموقعها الاستراتيجي داخل معلم بارز من معالمها وتحت منارة شامخة من منابرها. وتتكون من الآتي:
- قاعتين إحداهما للكتب، وأخرى للمطالعة، ينعم المستفيد فيها بخدمات المكتبة وتوفير الهدوء والاستقرار له. بعد ما تمت إضافة القاعة سابقا إليها لكثرة روادها من الطلبة والطالبات وحاجة كلية التربية إليها للتدريس في الجوانب العملية، وهي بذلك تعد قاعة تعليمية في كيفية استخدام الكتب والمراجع آنذاك.
