مقاييس قابلة للقياس تستخدمها الجامعة لتقييم أدائها وتقدمها نحو أهدافها الاستراتيجية والتشغيلية، حيث أن مؤشرات الأداء الرئيسة تساعد الجامعة في تحديد مدى نجاحها في تحقيق أهدافها الاستراتيجية والتشغيلية، وتحديد مجالات التحسين، واتخاذ قرارات مستنيرة بشأن خطط أعمالها. وتشمل مؤشرات الأداء في الجامعة المصادر التالية: مؤشرات أداء جامعة السلطان قابوس لقائمة الأهداف المنبثقة عن أولويات رؤية عمان2040 (وحدة متابعة تنفيذ رؤية عمان 2040)، مؤشرات الخطة السنوية للجامعة (الأمانة العامة لمجلس الوزراء)، مؤشرات ميزانية البرامج والأداء، وأية مؤشرات مؤسسية أخرى تستحدث لاحقا. حيث يعنى مكتب ضمان الجودة أيضا بالإشراف على منظومة مؤشرات الأداء الرئيسية بالجامعة والتعاون مع أصحاب المصلحة المعنيين لتحسين الأداء المؤسسي وتقديم الدعم لمراجعة صياغة المؤشرات ووضع البطاقات التفصيلية لها، ومواءمة هذه المؤشرات ضمن مصادر مختلفة، ووفقاً لمجالات وممكنات الخطة الاستراتيجية للجامعة 2016-2040.